Netbeans y C problema con ventana de consola duplicada

[Notanumber]

Buenas, he instalado netbeans y mingw para programar en C en windows 8.1 y tengo el siguiente problema, cuando corro el proyecto :
Selected console type is not supported in your configuration, using External terminal instead
Lo que he hecho es cambiar en properties- run - external terminal, de esta forma lo he solucionado, pero cuando ejecuto un programa pasa lo siguiente, aparecen como dos consolas y tengo que introducir los datos dos veces.
La imagen de lo que me pasa se puede consultar en este enlace: http://forums.netbeans.org/viewtopic.php?p=159747#159747
Gracias por su ayuda.

[javi in the sky]

Hola, prueba lo siguiente:

Añade esta línea al principio del código de tu proyecto:

setbuf(stdout, NULL);

Puede haber alguna instrucción en el código que esté afectando ¿puedes pegar el código que estás intentando correr?