Hola Luis, puedes intentar varias cosas:
a) Abre "Equipo". Haz click con botón derecho en la carpeta C:
Selecciona "Propiedades". Selecciona "Herramientas". Selecciona "Comprobar errores (para comprobar el disco para solucionar errores en el sistema de archivos). Haz click en aceptar. Si te aparece el mensaje "No se puede hacer el chequeo del disco mientras está en uso intente hacerlo en un próximo arranque". Haz click en aceptar y deja que el sistema se reinicie. Comprueba si al reiniciar se ha solucionado el problema.
b) Si el sistema tiene daños múltiples tendrías que buscar un punto de restauración antes de que el sistema se volviera inestable (a través del centro de copias de seguridad y restauración de Windows).
c) Si no puedes recuperar hacerlo con una recuperación total (implica pérdida de datos y programas instalados)
Saludos