Código propuesto como respuesta al ejercicio CU00662B:
import java.util.*;
public class Comparadora{
public static void main(String [] args){
String cadena1="";
Scanner Escaner1=new Scanner(System.in);
System.out.println("Introduce la primera palabra:");
String Palabra1=Escaner1.nextLine();
System.out.println("Introduce la segunda palabra:");
String Palabra2=Escaner1.nextLine();
for(int i=0;i<Palabra1.length()||i<Palabra2.length();i++){
if(Palabra1.length()>=i+1 && Palabra2.length()>=i+1)
{cadena1=""+Palabra1.substring(i,i+1).equals(Palabra2.substring(i,i+1));}
else if(Palabra1.length()<i+1)
{cadena1="La palabra 1 no tiene letra "+(i+1);}
else {cadena1="La palabra 2 no tiene letra "+(i+1);}
System.out.println("Letra "+(i+1)+" igual en las dos palabras? \n"+cadena1);
}//Cierre del bucle for
}//Cierre del metodo main
}//Cierre de la clase comparadora