Hola de nuevo Angel1232.
Al principio del código creas una variable que no se utiliza para nada int aux, arrelo[] , elem, elem1;.
Este es el codigo de como lo haría yo:
import java.util.Scanner;
import javax.swing.JOptionPane;
public class JavaApplication14 {
public static void main(String[] args) {
Scanner lec=new Scanner(System.in);
int aux,arreglo[],elem,elem1;
elem = Integer.parseInt(JOptionPane.showInputDialog("Entre el numero de elementos para el primer array: "));
arreglo = new int [elem];
for(int i=0;i<elem;i++){
System.out.println(".-Valor del elemento"+(i+1)+"del primer array");
arreglo[i]=lec.nextInt();
}
for(int i=0;i<(elem-1);i++){
for(int j=0;j<(elem-1);j++){
if(arreglo[j]>arreglo[j+1]){
aux = arreglo[j];
arreglo[j]=arreglo[j+1];
arreglo[j+1] =aux;
}
}
}
elem1 = Integer.parseInt(JOptionPane.showInputDialog("Entre el numero de elementos para el segundo array: "));
int[] arreg = new int [elem1];
for(int i=0;i<elem1;i++){
System.out.println((i+1)+".-Valor del elemento"+(i+1)+"del segundo array");
arreg[i]=lec.nextInt();
}
for(int i=0;i<(elem1-1);i++){
for(int j=0;j<(elem1-1);j++){
if(arreg[j]>arreg[j+1]){
aux = arreg[j];
arreg[j]=arreg[j+1];
arreg[j+1] =aux;
}
}
}
/*Después de ordenar los dos arrays creo un nuevo array para introducir en él
los elementos de los dos arrays ordenados y vuelvo a ordenar este array para tener los tres arrays ordenados*/
int ordenados[]= new int [elem+elem1];
int z=0;
System.out.print("numeros ordenados primer array\n");
for(int i=0;i<arreglo.length;i++){
ordenados[z]=arreglo[i];
z++;
//presento en pantalla el primer array ordenado
System.out.print(arreglo[i]+", ");
}
System.out.print("\nnumeros ordenados segundo array \n");
for(int i=0;i<arreg.length;i++){
ordenados[z]=arreg[i];
z++;
//presento en pantalla el segundo array ordenado
System.out.print(arreg[i]+", ");
}
for(int i=0;i<ordenados.length-1;i++){
for(int j=0;j<ordenados.length-1;j++){
if(ordenados[j]>ordenados[j+1]){
aux = ordenados[j];
ordenados[j]=ordenados[j+1];
ordenados[j+1] =aux;
}
}
}
System.out.print("\nnumeros de los dos arrays ordenados\n");
for(int i=0;i<ordenados.length;i++){
//Presento en pantalla el tercer array ordenado
System.out.print(ordenados[i]+", ");
}
}
}